پس از اشغال ایران توسط انگلیس و روسیه در سال 1320 دولت انگلیس مصرا خواستار توقیف و تبعید آیتالله کاشانی شد و دولت سهیلی که دستور بازداشت بیش از 160 نفر را به جرم عضویت در ستون پنجم آلمان صادر کرد، دستور توقیف آیتالله کاشانی را نیز صادر نمود. به این ترتیب آیتالله کاشانی در 27 خرداد 1323 دستگیر شد و به مدت یک سال و اندی زندانی متفقین بود. ایشان از هر گونه تماس با همبندان خود نیز پرهیز میکردند تا جاسوسی در بین آنها نباشد.
انوشیروان خلعتبری، محبوسین متفقین در ایران، تهران، اهورا، 1385، ص 117