این روش تقریبا در تمام مواردی که از کلر استفاده می شود قابل جایگزینی است ؛ با این تفاوت که قابلیت حذف ویروس ها نیز به آن اضافه می شود.
زیرا در روش کلرزنی ویروس ها حذف نمی شوند. پس بهتر است در استخرها از روش گندزدایی الکترونیکی استفاده شود، چون تمام مزایای کلرزنی را دارد.
اما مضرات کلر از جمله سمی بودن حساسیت ارگان های بدن انسان مانند پوست و چشم به آن ، بوی بد و نگهداری دشوار آن ، کنترل میزان آن در آب و... را ندارد.
در صنعت هر جا نیاز به حذف جلبک ، خزه ، باکتری یا ویروس باشد مانند سیستم توزیع و نگهداری آب ، سیستم های موتور خانه ای بخصوص بویلرها، چیلرها و از همه مهمتر برجهای خنک کن که مشکل خزه و جلبک در آنها حاد است ، براحتی استفاده می شود.
در آب و فاضلاب می توان از آن به عنوان یک ضدعفونی کننده بسیار قوی استفاده کرد که کاربرد زیادی در روشهای پیش تصفیه آب دارد.
از انواع کوچک و کم هزینه آن می توان به عنوان یک میکرب زدا استفاده کرد.
همچنین از این روش می توان به عنوان یک راه حل مناسب برای پسابهای صنعتی و حذف میکروارگانیزمهای ناشی از آن استفاده کرد که لزوم آن در آبهای بیمارستانی بیش از پیش حس می شود و تقریبا تنها روش مقابله با آلودگی ناشی از آن است.