وقتی امام فرمان فرار سربازان از پادگانها را صادر کرد شهید حسن باقری یکی از اولین سربازانی بود که بیلحظهای درنگ خدمت را رها کرد و به مردم پیوست تا دوش به دوش آنها مبارزه کند. او نقش عمدهای در تصرف کلانتری 14 و پادگان عشرت آباد سابق را داشت. بعد از انقلاب تا خرداد 58 در کمیته انقلاب اسلامی فعالیت داشت و سپس همکاری خود را با روزنامه جمهوری اسلامی آغاز کرد.
کد خبر: ۲۰۴۷۷۳
در این مدت سفری هم به لبنان و اردن داشت و گزارش تحلیلی جامعی از اوضاع بد مسلمین آن منطقه تهیه کرد. دیپلمش را که گرفت کنکور داد و با رتبه 104 در رشته حقوق قضای دانشگاه تهران قبول شد. سال 59 عضو سپاه شد و در مقابله با گروهکهای منحرف فعالیت چشمگیری داشت. شروع جنگ اما نقطه عطف زندگی او بود. او بلافاصله پس از شروع جنگ راهی جبهههای جنوب شد و تا آخرین لحظه حیات در جبهه ماند و جنگید.
هیچ کس باور نمیکرد یک دانشجوی 25ساله بتواند مسیر جنگ را عوض کند. آن هم با تاسیس واحد اطلاعات و عملیات سپاه پاسداران. با تصرف خرمشهر، هیچ کس گمان نمیکرد فرماندهان ایرانی بتوانند این شهر را از عراق پس بگیرند اما اینجا هم باز راهبرد شهید باقری به کار آمد تا در یک نبرد 23 روزه خونین شهر آزاد شود. به خاطر همین ایدههای خلاقانه بود که به عنوان معاون فرمانده نیروی زمینی سپاه انتخاب شد. پیشبینیهای شهید باقری از حرکات احتمالی دشمن معروف بود. مثلا وقتی حرکت دشمن را جهت الحاق محور شمال جنوب سوسنگرد برای ارتباط جفیر و بستان پیشبینی کرد خیلیها مبهوت هوش و استعداد او ماندند. تواضع او مثالزدنی بود به طوری که همسرش تا مدتها نمیدانست او سمت فرماندهی در جبهه دارد و هر بار که از او میپرسید در جبهه چه کار میکنی پاسخ میشنید: من سقای بچههای بسیجیام! او سرانجام در زمستان 61 وقتی در جبهه فکه مشغول شناسایی منطقه دشمن بود در سنگر دیدهبان مورد اصابت گلوله خمپاره عراقیها قرار گرفت تا روح بلندش به لقای سرورش امام حسین بپیوندند. او در زمان شهادت فقط 27 سال داشت.