انتخاب شهردار تهران و رایزنی های زودهنگام در خصوص شخص پیشنهادی گروههای اصلاح طلب و اصرار بر آن باعث بروز اختلاف هایی در این شورای تازه تاسیس شده است . اگرچه پیش از این نام افرادی مانند نجفی (وزیر سابق آموزش و پرورش) و حتی معصومه ابتکار (معاون سابق رئیس جمهور) از سوی احزاب دوم خردادی برای شهرداری تهران مطرح بود ، با این حال به نظر می رسد رقابت جدید میان نجفی ، مهرعلیزاده و حبیب الله بیطرف که هر کدام نمایندگی طیف خاصی را در شورای هماهنگی اصلاح طلبان برعهده دارند ، آغاز شده است . محمدعلی کوزه گر ، عضو شورای مرکزی حزب اراده ملت ایران از گروههای شورای هماهنگی جبهه اصلاحات با تایید خبر وجود رقابت زودهنگام در این شورا برای معرفی شهردار آینده تهران در صورت پیروزی احتمالی در انتخابات می گوید: در شورای هماهنگی اصلاح طلبان 3 گروه از 3 شهردار حمایت می کنند. حامیان ، کارگزاران و اعتدال و توسعه از شهردار شدن محمدعلی نجفی ، گروه دیگری هم از محسن مهرعلیزاده و برخی گروهها نیز از نشستن حبیب الله بیطرف (عضو شورای مرکزی جبهه مشارکت) بر مسند شهرداری تهران حمایت می کنند. کوزه گر در مصاحبه با باشگاه خبرنگاران جوان افزود: در نشستهای اخیر جبهه اصلاحات ، بحث در این مورد بالا گرفته است ، ولی به توصیه سیدمحمد خاتمی و برخی بزرگان دیگر قرار شده تا اطلاع ثانوی از پرداختن به این مساله خودداری و تمام توان برای پیروزی در انتخابات به کار گرفته شود. با این حال ، علی رغم توصیه سیدمحمد خاتمی شواهد حکایت از آن دارد که بار دیگر خاطره جنجال ها و بگومگوهای سیاسی در دوره اول فعالیت شوراهای اسلامی شهر و روستا بویژه در تهران که یکی از دلایل اصلی رویگردانی مردم از فعالان سیاسی و اجتماعی دوم خردادی بود در حال تجدید شدن است .همچنین شنیده شد برخی اصلاح طلبان نیز به دنبال حمایت از قالیباف در صورت پیروزی در انتخابات شوراها هستند و به وی اطمینان داده اند در صورت پیروزی ، وی شهردار تهران باقی می ماند.