لایه های فسیل دار ایران در منطقه مراغه اولین بار به وسیله مسافران روسی در سال 1840 میلادی کشف شدند و جمع آوری ابتدایی آنها از سوی شخصی به نام آبیخ در سال 1957 انجام گرفت. تا پیش از سال 1881 میلادی کار چشمگیری در این زمینه صورت نگرفت ، تا این که در این سال 2 روسی مطالعاتی در این باره انجام دادند. در سال 1884 میلادی دیرینه شناس اتریشی هم در این زمینه به فعالیت پرداخت و سپس پروفسور رودلر در سال 1885 میلادی لایه های فسیل دار را بررسی کرد.
فسیلهای جمع آوری شده به وسیله این محققان مطالعه شدند و امروزه این فسیلها در موزه تاریخ طبیعی وین قرار دارند. در سال 1900 شخصی انگلیسی به صورت مختصر به حفاری در منطقه پرداخت و فسیلهایی که به دست آورد به وسیله شخصی به نام فورسیت در سال 1904 مطالعه شدند. این فسیلها هم در موزه تاریخ طبیعی لندن نگهداری می شوند. در سال 1904 دیرینه شناس فرانسوی به مدت 3 ماه همراه 12 نفر حفاری وسیعی در مراغه و بالاخص در مناطق کرج آباد نزدیک رودخانه مراق چاق ، کوپران ، شلیلوند و کرمجوان انجام داد و در سال 1924 گزارشی را درباره منطقه فون مراغه منتشر کرد.
براساس گزارش او ، فون مراغه نوعی است که اصطلاحا به آن پوفسیل اطلاق می شود که عمدتا و به صورت گسترده تا اطراف دریای سیاه را دربر می گیرد که معمولا شامل میوسن بالایی و پلیوسن پایینی می شود.
زارع در زمینه جمع آوری فسیلهای مهره داران منطقه مراغه می گوید: سازمان حفاظت محیط زیست در تهران فعالیت هایی از سال 1974 با همکاری دانشگاه UCLA و موزه کانتی لس آنجلس به سرپرستی پروفسور برنارد کمپل شروع کرد. این گروه در مدت 3 سال یعنی از سال 1974 تا 1976 حفاری و جمع آوری فسیلها را انجام داد ؛ ولی پس از انقلاب ادامه نیافت. فسیلهای یافت شده منطقه فسیلی مراغه در این طرح شامل انواع هیاریون ، فسیلهای اکتشاف شده ، زرافه ها شامل گردن کوتاه و گردن بلند ، آنتیلون ها شامل آهوان ، گوزن ها، ببردندان شمشیری و خرسها ، همچنین جنسهایی از گاوها و انواع جوندگان اکتشاف و مطالعه شده اند. طرح نخستین مرکز تحقیقات فسیل شناسی خاورمیانه قرار است طی 2 سال و در زمینی به مساحت 10 هکتار ساخته شود. علت اصلی انتخاب این محل آن است که منطقه فسیلی مراغه به بهشت فسیل شناسی حیوانات معروف است و در آن فسیل مهره دارانی با قدمت 7 تا 12 میلیون سال پیدا شده است. قرار است این مرکز در سال 1387 به بهره برداری برسد.