متن حکم رهبر انقلاب اسلامی به این شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
نقش مؤثر و شایسته دانشگاه امام صادق(ع) و دستاندرکاران صدیق آن بویژه عالم مجاهد و روشنبین مرحوم آیتالله مهدویکنی از ابتدا تاکنون در گسترش پژوهشهای کاربردی اسلامی و تربیت و تأمین بخشی از نیازهای کارشناسی و مدیریتی نظام جمهوری اسلامی بر هیچکس از آشنایان این مؤسسه مبارک، پوشیده نیست. برای تعالی و ادامه این نقش و با توجه به ضرورت صیانت و اعتلای این حرکت علمی مبتنی بر معارف اسلامی که به همّت بلند و زحمات مخلصانه مرحوم آیتالله مهدویکنی اعلیاللهمقامه پایهگذاری شده و به شکوفایی رسیده است، پس از ترسیم راهبردهای روشن و اطمینانبخش، نیاز به هیات امنایی متناسب با اهمیت این دانشگاه، احساس میگردد، لذا حضرات آیات و حججاسلام باقریکنی، آملیلاریجانی، سیداحمد علمالهدی، سعید مهدوی کنی، علیرضا امینی، احمد واعظی، سیدعباس موسویان، سیدمصطفی میرلوحی و آقایان سیدعلا میرمحمّدصادقی، دکتر علی رضائیان و دکتر هادی همایون به عنوان هیات امنای مؤسسه جامعهالامامالصادق تعیین میگردند که در اولین فرصت با بهرهگیری از میراث و تجربیات گذشته و با رعایت راهبردهای ابلاغی که به پیوست خواهد آمد، به تنظیم و تصویب اساسنامه جدیدی مبادرت ورزند تا بر آن اساس و با تلاشهای جدی خود نصاب این تشکیلات علمی را بهعنوان یکی از مهمترین کانونهای اعتلای معارف اسلامی و تحول علوم انسانی در کشور ارتقا بخشند. حضور جناب آقای آملیلاریجانی در صدر این هیات امنا فرصتی برای دستیابی هر چه زودتر به اهداف مذکور خواهد بود انشاءالله. توفیقات آقایان محترم را از خداوند متعال مسألت مینمایم.
سیدعلی خامنهای / 25 خرداد 94