رییس جمهوری سابق ایران در بخش دیگری از سخنانش به عملکرد خود در زمینه آزادی فعالیت احزاب و تشکلها و ایجاد فضای باز در کشور اشاره کرد اما در عین حال پذیرفت که دولت او کاستیهایی در این زمینه داشته است.
خاتمی اظهارداشت:" از افتخارات دوران ریاست جمهوری ام این است که فضای کشور باز شد، البته این امرهزینه هایی را هم به همراه داشت؛ مثل یک مزرعه که وقتی آبیاری می شود ممکن است علف هرزه نیز در آن رشدکند ولی به خاطر رشد چند علف هرزه نمی توان مزرعه مؤثر و مفیدوهمه درخت ها را از بین برد."
وی افزود: "مگر ما می گفتیم اگر یک روزنامه ، جناح و جریان سیاسی حرفی را بزند که امنیت ملی را از بین ببرد ، با آن برخورد نشود؛ ما می گفتیم طبق قانون اساسی و ضابطه اتهام ابلاغ شود؛او بتواند وکیل بگیرد ، در دادگاه صالحه بررسی شود، هیات منصفه حضور داشته باشد و روی روال معمولی بررسی شود".
رییس موسسه بین المللی گفت و گوی فرهنگها و تمدنها تصریح کرد:باید از دستاوردی که حاصل انقلاب اسلامی و روح انقلاب است دفاع کنیم و در عرصه حضور داشته باشیم.
به عقیده خاتمی ؛ "متاسفانه در فضای کنونی کشور، رسانه های فراگیر با انصاف برخورد نمی کنند و مسائل را وارونه به مردم می رسانند و از بسیاری از مراکز و محافلی که باید کارکرد آنها فرا جناحی باشد، سوء استفاده می شود".
سیدمحمدخاتمی در مجموع گفت:باید کنار همدیگر بود، تجربیات گذشته را در نظر گرفت و اختلاف سلایق سبب نشود ما از همدیگر جدا شویم بلکه سبب تکامل همدیگر شویم .
وی ابراز امیدواری کرد زمینه ای فراهم شود که قانون اساسی آنطور که باید در انتخابات پیاده شود و تعیین کننده نهایی مردم باشند "چون رأیی که در جریان سالم و رقابتی بروز پیدا می کند به نفع اسلام، انقلاب و جامعه و پیشرفت ماست."