طی حکمی از سوی محمدشریف خانی معاونت فضای مجازی رسانه ملی، محمدمهدی خاموشیان به سمت مسؤول قرارگاه رسانهای معاونت فضای مجازی منصوب شد. در این حکم آمده است: «توجه به اصول مهم پوشش رسانهای، تحول آفرینی هدفمند در حوزه اطلاعرسانی، ایجاد بسترهای نوآوری و مخاطبپذیری در عملکرد وظایف سازمانی و بنا قراردادن نگاه جامع محور و اثربخش به مسائل روز حوزه معاونت و انعکاس پژوهانه و عالمانه آن به جامعه مخاطب درون و برون سازمانی از الزامات و اهم فعالیتهای این مدیریت است.»
محمدمهدی خاموشیان در حال حاضر به عنوان مشاور و رئیس دفتر معاونت فعالیت دارد که با حفظ سمت به سمت مسؤول قرارگاه رسانهای معاونت فضای مجازی منصوب شده است.