فرمانده نیروی قدس سپاه پاسداران انقلاب اسلامی در پیامی به‌مناسبت شهادت دکتر فخری‌زاده تأکید کرد: با تمامی نیروهای مدافع میهن اسلامی در گرفتن انتقام خون این شهید عزیز و تمامی شهدا از تروریست‌های کوردل و اربابانشان هم‌پیمان می‌شویم.
سخنگوی وزارت امورخارجه کشورمان اخبار منتشر شده در خصوص حکم ۲۰ سال حبس برای اسدالله اسدی دیپلمات کشورمان را نادرست خواند.
همسر شهید محسن فخری‌زاده گفت: این شهید در عین حال که یک دانشمند بودند، بسیار همسر مهربان و دلسوز و مدبری بودند و کشورشان را دوست داشتند و من از آنهایی که هستند خواهش می‌کنم راه ایشان را ادامه دهند و اجازه ندهند خونش پایمال شود.
رئیس قوه قضاییه گفت: دلیل این که شهید فخری زاده مورد خشم و غضب دشمن قرار گرفت، این بود که آمریکا و صهیونیست‌ها تصور می کردند باید علم و تکنولوژی در انحصار آنها باشد اما او یکی از افرادی بود که این باور آنها را باطل کرد.
رژیم صهیونیستی از ابتدای تاسیس تا‌کنون یک هدف ثابت را در کنار مجموعه اهداف دیگر خود پیگیری می‌کند و آن حذف برخی افرادی است که ممکن است در دراز‌مدت برای اسرائیل به نحوی خطر‌آفرین باشند.
بلافاصله بعد از ترور شهید محسن فخری‌زاده چهره علمی صنعت دفاعی کشور، رسانه‌های غربی به‌جای تقبیح این اقدام تروریستی، تلاش کردند با انتساب عبارت برنامه هسته‌ای نظامی به وی، ترور را طبیعی جلوه دهند درحالی که آخرین پروژه‌اش که در حال اجرا ناتمام ماند، تلاش برای حفظ جان انسان‌ها در مقابل کرونا بود.
رژیم صهیونیستی در گذشته اعلام کرده بود قصد ترور یکی از دانشمندان و چهره‌های تاثیرگذار علمی کشورمان را دارد، بنابراین چنین تروری از قبل در برنامه موساد بوده است.
فرمانده نیروی قدس سپاه پاسداران در صفحه شخصی خود در توئیتر نوشت: دشمن عُرضه جنگ مردانه با ایران را ندارد. مرگ اسرائیل نزدیک است.
حضرت آیت‌الله خامنه‌ای رهبر انقلاب اسلامی در پی ترور دانشمند هسته‌ای شهید، دکتر محسن فخری‌زاده پیامی صادر کردند.
فرمانده نیروی دریایی ارتش با بیان اینکه همگام با پیشرفت انقلاب، نیروی دریایی کار خود را برای ساخت تجهیزات پیش برد و امروز می‌بینیم هر آنچه که در دریا نیاز داریم را خودمان ساخته‌ایم، گفت: امروز آن‌قدر انباشت بزرگی از علم و فناوری و زیرساخت ها و دانش دفاعی را در دست داریم که هیچ وابستگی به خارج نداریم.
رئیس جمهور گفت: ملت و مسئولان کشور شجاع‌تر و غیورتر از آن هستد که این جنایت را بی پاسخ بگذارند و در موقع مناسب پاسخ این جنایت را خواهند داد.
گزارشگر ویژه سازمان ملل با تلقی کردن ترور محسن فخری زاده به عنوان «یک قتل هدف دار برون مرزی و در یک درگیری مسلحانه» آن را تخطی از حقوق بشر دانست.
نایب رییس کمسیون امنیت ملی و سیاست خارجی مجلس شورای اسلامی از برگزاری جلسه این کمیسیون برای بررسی ابعاد ترور رییس سازمان پژوهش و نوآوری وزارت دفاع خبر داد.
رئیس جمهور با صدور پیامی شهادت محسن فخری زاده را تسلیت گفته و تاکید کرد: بی شک این حادثه تروریستی و مذبوحانه ناشی از عجز و ناتوانی دشمنان قسم خورده ملت ایران در برابر حرکت علمی و افتخارات و توانمندی‌های ملت بزرگ ایران و شکست‌های پی در پی آنان بوده است.
محسن فخری‌زاده رئیس سازمان پژوهش و نوآوری وزارت دفاع عصر جمعه توسط یک تیم ترور در دماوند(حومه تهران)ترور شد و به شهادت رسید.محسن فخری زاده پروژه‌های مختلف و مهمی را مدیریت میکرد وپیش از این بارهاتوسط رژیم صهیونیستی تهدید شده بود.از مهمترین پروژه‌هایی که توسط این شهید و تیمش به نتیجه رسید،پروژه تولید اولین کیت ایرانی تشخیص کرونابودکه سازمان تحت امرش با نظارت مستقیم این شهید عزیز سرانجام بعد از تلاشهای فراوان در ابتدای سال جاری موفق به تولید این کیت شدند.
وزیر دفاع و پشتیبانی نیروهای مسلح درباره علت بکار بردن عنوان «دانشمند هسته‌ای» برای شهید محسن فخری زاده گفت که شهید محسن فخری زاده ر حوزه پدافند هسته‌ای وزارت دفاع مدیریت می‌کرده و موضوع پدافند هسته و محشور شدن ایشان با دانشمندان هسته‌ای باعث شده بود که به چنین عنوانی شهرت داشته باشد.
سفیر و نماینده دائم کشورمان در سازمان ملل طی نامه ای به دبیرکل سازمان ملل و رییس شورای امنیت، ضمن مسئول دانستن آمریکا و اسراییل در این حمله ناجوانمردانه، از آنها خواست ضمن محکوم کردن این ترور، اقدامات لازم را در این زمینه به عمل آورند.
وزیر امور خارجه ایران در بیانیه ای اقدام تروریستی و کوردلانه ترور شهید محسن فخری زاده دانشمند برجسته کشور را به شدت محکوم کرد.
وزارت دفاع و پشتیبانی نیروهای مسلح، شهادت محسن فخری‌زاده، معاون وزیر و رئیس سازمان پژوهش و نوآوری دفاعی (سپند) در یک عملیات تروریستی را تائید کرد.
خطیب جمعه تهران گفت: مشکل ترخیص کالا از گمرک و نظایر آن که مردم را با مشکلات مواجه می‌کند، به خاطر نادانی، سستی و بی توجهی مسئولان مربوطه است.